日本地处温带和亚热带，气候温和、四季分明。日本全国横跨纬度达25°，南北气温差异十分显著。北海道与本州的东北地区、高
东京繁华的夜景
东京繁华的夜景
原地带属温带，本土大部地区及冲绳等南方诸岛则为亚热带。此外，日本所处位置令她受到季候风及洋流交汇的影响，因此四季分明、降水充沛。
日本是世界上降水量较多的地区。主要原因包括了日本海侧地区冬季的降雪；6、7月（冲绳、奄美为5、6月）间连绵不断的梅雨；以及夏季到秋季登陆或接近日本的台风。日本有记载的最高温度纪录是40.9度，于2007年8月16日在崎玉县熊谷市和岐阜县多治见市测得；有记载的最低温度纪录是-41度，于1902年1月25日在北海道旭川市测得。
地形

日本境内多山，山地成脊状分布于日本的中央，将日本的国土分割为太平洋一侧和日本海一侧，山地和丘陵占总面积的71%，国土森林覆盖率高达67%。富士山是日本的最高峰，海拔3776米。富士山被日本人尊称为：圣岳。
日本的平原主要分布在河流的下游近海一带，多为冲积平原，规模较小，较大的平原有关东平原、石狩平原、越后平原、浓尾平原、十胜平原等。日本平原面积狭小，耕地十分有限，人口生理密度高达2924人/平方公里，为世界第26位。